Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms