Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Smim8Q9CQQ0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim8Q9CQQ0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms