Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Nudt21Q9CQF3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms