Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl39lQ9CQD0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms