Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ncbp2Q9CQ49 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms