Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg3Q9CPX6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg3Q9CPX6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg3Q9CPX6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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