Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q9CPS8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q9CPS8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q9CPS8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms