Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms