Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms