Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nup155Q99P88 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms