Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrrtQ99MR6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms