Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprtQ99M80 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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