Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nus1Q99LJ8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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