Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Emc3Q99KI3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Emc3Q99KI3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms