Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Lims1Q99JW4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms