Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pacsin3Q99JB8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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