Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms