Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ccdc28aQ8CEI3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc28aQ8CEI3 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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