Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q8BP99 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BP99 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BP99 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q8BP99 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BP99 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q8BP99 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BP99 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q8BP99 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BP99 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q8BP99 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Q8BP99 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BP99 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BP99 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Q8BP99 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Q8BP99 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BP99 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BP99 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BP99 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Q8BP99 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q8BP99 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BP99 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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