Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp54Q8BL06 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp54Q8BL06 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp54Q8BL06 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp54Q8BL06 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp54Q8BL06 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp54Q8BL06 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp54Q8BL06 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms