Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrfn4Q80XU8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms