Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Shq1Q7TMX5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Shq1Q7TMX5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Shq1Q7TMX5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shq1Q7TMX5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms