Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms