Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xrcc1Q60596 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms