Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms