Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ulk4Q3V129 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ulk4Q3V129 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms