Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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BB287469Q3UT53 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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BB287469Q3UT53 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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BB287469Q3UT53 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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BB287469Q3UT53 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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