Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms