Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Puf60Q3UEB3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms