Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MestQ07646 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MestQ07646 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms