Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gjb5Q02739 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms