Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp9bP98195 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms