Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rps3aP97351 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms