Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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