Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Epb42P49222 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Epb42P49222 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms