Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf4P43488 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms