Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pik3caP42337 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms