Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms