Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkcdP28867 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkcdP28867 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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