Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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