Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ifrd1P19182 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ifrd1P19182 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ifrd1P19182 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ifrd1P19182 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ifrd1P19182 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms