Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms