Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nr4a1P12813 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms