Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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