Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01672 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01672 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01672 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01672 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01672 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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