Protein–RNA interactions for Protein: P01670

Ig kappa chain V-III region PC 6684, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01670 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01670 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01670 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01670 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01670 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01670 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms