Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ColqO35348 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
ColqO35348 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
ColqO35348 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ColqO35348 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ColqO35348 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ColqO35348 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms