Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Kpna3O35344 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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