Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Bbip1J3QMK2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms