Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms